中國海關總署禁止台灣水產品輸入，上百家未完成生產企業註冊更新的食品業者暫停進口。統一協助企業申請更新中國輸銷註冊的窗口衛福部，對此「一問三不知」。衛福部部長薛瑞元說，農委會接到訊息才開始了解，食藥署會跟農委會再索取資訊。食藥署署長吳秀梅說，中方完全沒通知，但食藥署會做該做的事。

二○二一年四月十二日中國發布「中華人民共和國進口食品境外生產企業註冊管理規定」，要求全球輸銷中國的食品生產、加工、貯存企業，自二○二二年起都需要向中國海關總署申請註冊，其中有十八類的食品需要出口國方的主管機關向中國推薦註冊。

十八類食品中，陸僅提供十四類供台灣申請，包括水產品、乳品、蜂產品、食用油脂和油料、包餡麵食、食用穀物、穀物製粉工業產品和麥芽、保鮮和脫水蔬菜以及乾豆、調味料、堅果與籽類、乾果、特殊膳食食品、保健食品、未烘焙咖啡豆。

農委會副主委陳駿季表示，目前有一百多家水產品企業申請輸銷中國大陸，但僅有一家被核准，其餘企業註冊補件統統未通過，目前已知未通過的品項為魷魚、秋刀魚、午仔魚等。詳細原因待衛福部確認。

薛瑞元表示，據食藥署回報，此次受影響是有漁船捕撈的水產品及食品加工業者，被暫停輸銷的訊息是「業者主動通報」，非中方通知，大多數的項目都屬農委會管轄，但食藥署是此次中國管制措施的窗口，將進一步了解。

吳秀梅說，食藥署近期協助業者補件，該補件都補件、該交的文件都交了，「目前還不了解發生什麼事」，會持續與中國大陸聯繫，做食藥署該做的事。不過，依往例，中國大陸平常都沒在通知台灣，此次突然阻擋，問了恐怕也得不到回覆。

稱該做的都做的食藥署，截至截稿都沒辦法說明至今已協助多少家食品業者向大陸申請送件，也表明不知道有多少業者完成申請。

台灣糖果餅乾麵食工業同業公會副理事長洪建龍表示，食藥署於八月底曾說要協助業者採「包裹式」註冊登記，不少廠商直接選擇不參加，採自行填報輸銷。經由食藥署協助，約有半數未通過中國的註冊登記，部分是資料填寫不齊全要求補件。

台灣蜜蜂與蜂產品學會理事長陳裕文表示，學會輔導的業者，今年八月就已經無法進口到大陸。

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